Kalite Kontrol Departmanı tüm sebamed ürünleri için belirlenen sıkı kalite gerekliliklerine uygunluğun denetlenmesinden sorumludur. Ham maddeden ambalaj ve nihai ürüne kadar tüm madde ve öğeler mükemmel bir hale gelene kadar katı yönergeler doğrultusunda dikkatle incelenir. Hiçbir sebamed kabı, flakonu veya tüpü Kalite Kontrol Departmanı tarafından onaylanmadan piyasaya sürülmez. Kalite Kontrol Departmanının sıkı kalite kontrolü olmasaydı, sebamed ürünlerinin alt sözleşmeli imalatçılar tarafından uygun maliyetli bir şekilde üretilmesi mümkün olmazdı. Kontroller tesiste üretime başlanmadan önce, üretim sırasında ve bitmiş ürün üzerinde gerçekleştirilir. Bileşenlerin saflığı, kimliği ve konsantrasyonu Analiz Departmanı tarafından HPLC (yüksek basınçlı sıvı kromatografisi) ve GC (gaz kromatografisi) gibi en son teknolojileri kullanarak incelenir. Bitmiş üründeki tekil maddelerin seviyelerinin de incelenmesiyle kalite kontrol sistemi tamamlanır.